منذ بداية الوباء، لعبت الاختبارات التشخيصية دورًا حيويًا في السيطرة على انتشار فيروس SARS-CoV-2، وهو الفيروس الذي يسببكوفيد-19.اختبارات المستضدات السريعةيتم إجراؤها في المنزل أو في بيئة سريرية وتوفر النتائج خلال 15 دقيقة أو أقل.كلما تم تشخيص الشخص في وقت مبكر، كلما تمكن من طلب الرعاية الطبية وعزل نفسه عن الآخرين بشكل أسرع.ولكن عندما تظهر متغيرات جديدة للفيروس، فقد لا يتم اكتشاف تلك المتغيرات بواسطة هذه الاختبارات.
تم تصميم معظم اختبارات المستضدات السريعة للكشف عن بروتين القفيصة النووية SARS-CoV-2 أو بروتين N.ويوجد هذا البروتين بكثرة في الجزيئات الفيروسية والأشخاص المصابين.طقم اختبار سريعتحتوي عادةً على اثنين من الأجسام المضادة التشخيصية المختلفة التي ترتبط بأجزاء مختلفة من البروتين N.عندما يرتبط الجسم المضاد بالبروتين N الموجود في العينة، يظهر خط ملون أو إشارة أخرى على مجموعة الاختبار، مما يشير إلى وجود عدوى.
يتكون البروتين N من 419 وحدة هيكلية من الأحماض الأمينية.ويمكن استبدال أي منها بحمض أميني آخر عن طريق الطفرة.مجموعة بحثية بقيادة دكتوراه.شرع فيليب فرانك وإريك أورتلوند من جامعة إيموري في التحقيق في كيفية تأثير هذا التغيير في الأحماض الأمينية على أداء اختبار المستضد السريع.واستخدموا تقنية تسمى المسح العميق للطفرة لتقييم كيفية تأثير كل طفرة في البروتين N الخاص بالفيروس في وقت واحد على الارتباط بالجسم المضاد التشخيصي.نُشرت نتائجهم في مجلة Cell في 15 سبتمبر 2022.
أنشأ الباحثون مكتبة شاملة تضم ما يقرب من 8000 طفرة في بروتين N.تمثل هذه المتغيرات أكثر من 99.5% من جميع الطفرات المحتملة.ثم قاموا بتقييم كيفية تفاعل كل متغير مع 17 جسمًا مضادًا تشخيصيًا مختلفًا مستخدمًا في 11 اختبارًا سريعًا متاحًا تجاريًا، بما في ذلك الاختبارات الشائعة.أطقم منزلية.
قام الفريق بتقييم طفرات البروتين N التي تؤثر على التعرف على الأجسام المضادة.وبناءً على هذه المعلومات، قاموا بإنشاء "ملف تعريف طفرة الهروب" لكل جسم مضاد تشخيصي.يحدد ملف التعريف هذا طفرات معينة في بروتين N والتي قد تؤثر على قدرة الجسم المضاد على الارتباط بهدفه.وأظهر التحليل أن الأجسام المضادة المستخدمة في الاختبارات السريعة اليوم تتعرف وتربط جميع المتغيرات السابقة والحالية لـ SARS-CoV-2 المثيرة للقلق والقلق.
وعلى الرغم من أن العديد من الأجسام المضادة التشخيصية تتعرف على نفس المنطقة من البروتين N، فقد وجد الباحثون أن كل جسم مضاد لديه توقيع فريد من طفرات الهروب.مع استمرار فيروس SARS-CoV-2 في التحور وإنشاء متغيرات جديدة، يمكن استخدام هذه البيانات لتحديد الأجسام المضادة لمجموعة الاختبار التي قد تحتاج إلى إعادة تقييم.
وقال أورتلوند: "يظل التحديد الدقيق والفعال للأفراد المصابين استراتيجية حاسمة للتخفيف من آثار كوفيد-19، وتوفر دراستنا معلومات عن طفرات SARS-CoV-2 المستقبلية التي يمكن أن تتداخل مع الاكتشاف"."النتائج الموضحة هنا تسمح لنا بالتكيف بسرعة مع هذا الفيروس مع استمرار ظهور متغيرات جديدة، مما يمثل آثارًا سريرية فورية وعلى الصحة العامة."
الخلفية: يكتشف الفحص العميق للطفرات الطفرات الهاربة في القفيصة النووية لـ SARS-CoV-2 باستخدام اختبارات المستضدات السريعة المتاحة حاليًا.Frank F.، Kin MM، Rao A.، Bassit L.، Liu H، Bowers HB، Patel AB، Kato ML، Sullivan JA، Greenleaf M.، Piantadosi A.، Lam VA، Hudson VH، Ortlund EA cell.2022 15 سبتمبر؛185(19):3603-3616.e13.وزارة الداخلية: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 أغسطس 2022 بميد: 36084631.
التمويل: المعهد الوطني للتصوير الطبي الحيوي والهندسة الحيوية NIH (NIBIB)، والمعهد الوطني للسكري وأمراض الجهاز الهضمي والكلى (NIDDK) والمعهد الوطني للحساسية والأمراض المعدية (NIAID)، وجمعية القلب الأمريكية.
NIH Research Matters هو تحديث أسبوعي لنتائج أبحاث NIH الرئيسية التي استعرضها خبراء NIH.يتم نشره من قبل مكتب الاتصالات والشؤون العامة لمدير المعاهد الوطنية للصحة.